Lilián Guerrero es doctora en Lingüística por la Universidad de Búfalo (Estados Unidos) y desde el 2006 es investigadora titular de tiempo completo en el Seminario de Lenguas Indígenas, en el Instituto de Investigaciones Filológicas de la Universidad Nacional Autónoma de México. Forma parte del Sistema Nacional de Investigadores de México (máximo nivel contemplado). En 2024 recibió el Premio Nacional Wigberto Jiménez Moreno del INAH a la mejor investigación en el área de lingüística.
La línea de investigación que define sus actividades académicas gira en torno a la descripción, documentación y tipología lingüística, así como el estudio de las lenguas indígenas mexicanas. Entre sus áreas de interés destacan el estudio de la interfaz sintaxis-semántica y los efectos pragmáticos en la selección de estructuras alternativas en oraciones simples y complejas; procesos de cambios de valencia, transitividad, y propiedades aspectuales de los predicados; la interfaz sintaxis-semántica y los efectos pragmáticos en la selección de estructuras. Su investigación se adscribe a la sintaxis funcional y descriptiva y, en particular, a los principios de la Gramática de Rol y Referencia. Ha realizado trabajo de campo en la lengua pima (Pilares, Sonora, 1995), yaqui (Estación Vícam, Sonora, desde 1996) y huichol (variantes de Jalisco y Nayarit, desde agosto 2008). Ha sido responsable y corresponsable de 7 proyectos de investigación con financiamiento, todos orientados al estudio de lenguas minoritarias habladas en México. Ha publicado una decena de libros y más de cincuenta capítulos de libros en editoriales de prestigio (entre ellas, Cambridge University Press, Mouton de Gruyter, Oxford University Press, John Benjamins, Language Science Press, entre otras); cuenta con una veintena de artículos de investigación en revistas de alto impacto y especializadas (International Journal of American Linguistics, Folia Lingüística, Onomázein, Liames, entre otras). Sus últimas dos publicaciones corresponden a los libros de autoría Gramática de la locación y el tiempo en yaqui (2023) y Transitividad (no) canónica. Reflexiones a partir de lenguas habladas en México, junto con Sergio Ibáñez y Yulma Mejía. Breviarios de Lingüística 1. México: UNAM, Posgrado de Lingüística
En docencia, ha impartido cursos a nivel licenciatura y posgrado en la Universidad de Sonora, la Universidad Autónoma de Querétaro, la Escuela Nacional de Antropología e Historia (ENAH), el Centro de Investigaciones y Estudios en Antropología Social (CIESAS) y en la Universidad de Jaén (España). Ha dirigido varias tesis de licenciatura, maestría y doctorado en las líneas de investigación que definen su trabajo.